“Le premier signal n’est pas encore vigilant” : variante Omicron vue d’Afrique du Sud

La variante Omicron va-t-elle changer la donne après la très contagieuse Delta, qui détient l’hégémonie mondiale ? Que cela constitue un tournant est encore une exagération. De nombreuses incertitudes subsistent encore sur le danger et l’infectiosité de ce variant aux multiples mutations. Mais les scientifiques craignent déjà qu’il soit hautement contagieux et qu’il échappe à certaines parties du système immunitaire.

La pollution et les hospitalisations ont déjà augmenté en Afrique du Sud ces dernières semaines. Le pays s’estime déjà “puni” par les mesures prises dans le monde après la détection de la sous-espèce, et certains pays africains ont suivi le vent de panique et imposé des restrictions aux déplacements vers le continent. Est considéré comme “triste” et “désolé”. Par conséquent, le président sud-africain Cyril Ramaphosa a appelé à une « levée immédiate et urgente » de ces mesures et les a considérées comme dépourvues de « justification scientifique ». Force est de constater que ces derniers jours ont été marqués par un grand nombre d’hypothèses autour d’Omicron.

Pour l’instant, “de légers symptômes”…

C’est certain à ce stade. Il existe de nombreuses mutations dans cette variante, qui sont concentrées dans certaines des protéines « péplomères » clés que le virus pénètre dans l’organisme. Ces caractéristiques génétiques, à un niveau théorique, font craindre que cette variante soit plus contagieuse et plus résistante aux vaccins que son prédécesseur. “Les variantes précédentes ont moins de 10 mutations dans cette protéine et plus de 30 variantes omicron. Cette variabilité suggère que l’efficacité du vaccin contre cette nouvelle variante doit être diminuée. C’est donc une préoccupation. ” Etienne Decroly, virologue dans une interview à L’Express.

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Après quelques jours d’informations incohérentes, l’OMS souligne qu’elle ne sait pas encore tout sur l’infectiosité et la gravité réelle de ce variant tantôt rassurant tantôt vigilant. Dans la première catégorie, des propos tenus par des médecins sud-africains et recueillis dimanche par l’AFP faisaient état de “symptômes bénins”, et certains commentateurs ont émis l’hypothèse qu’ils étaient plus contagieux mais moins à risque. ..

Ainsi, depuis 10 jours, Angélique Kotze, présidente de l’Association médicale sud-africaine, a soigné une trentaine de patients Covid contaminés par la nouvelle variante Omicron et n’a observé jusqu’à présent qu’une guérison sans hospitalisation. Elle a déclaré à l’AFP à Pretoria : “C’est une fatigue extrême qui les a conduits à ma pratique”. La majorité étaient des hommes de moins de 40 ans. Un peu moins de la moitié ont été vaccinés. En plus de la fatigue, elle a dit qu’ils souffraient de douleurs musculaires, d’une toux sèche ou de « démangeaisons de la gorge ». Il n’y avait qu’une légère fièvre.

Le Dr Coetzee a mis en garde les responsables de la santé le 18 novembre contre ce « tableau clinique delta-incompatible » (une variante auparavant prédominante en Afrique du Sud). Ils n’étaient pas surpris, le phénomène avait déjà été étudié. Elle rappelle que l’on sait peu de choses sur les dangers de cette variante. “Je ne dis pas qu’une maladie grave ne se produira pas”, a-t-elle déclaré, mais “pour l’instant, même les patients non vaccinés présentent des symptômes bénins”.

… mais l’explosion de l’incident

Encore une fois, soyez prudent à ce stade. “C’est trop tôt pour le dire”, a regretté l’infectiologue français Yazdan Yazdampana lors d’une réunion organisée par le Conseil scientifique, qui conseille le gouvernement sur la crise sanitaire, ce lundi. “Il y a jusqu’à présent peu de preuves de la gravité”, a-t-il soutenu, soulignant qu’il est impossible de tirer des conclusions à partir de témoignages isolés.

Au contraire, d’autres facteurs suscitent des inquiétudes. Selon l’épidémiologiste sud-africain Salim Abdool Karim, il s’agit d’une augmentation explosive du nombre de cas en Afrique du Sud, aux portes de plus de 10 000 cas par jour. “Il y aura une pression sur les hôpitaux dans les prochaines semaines”, a déclaré un épidémiologiste lors d’une conférence de presse en ligne au ministère de la Santé.

La pollution a déjà augmenté rapidement en Afrique du Sud ces dernières semaines. Environ 2 800 nouveaux cas ont été enregistrés dimanche, 500 la semaine dernière et 275 auparavant. Gauteng, l’État le plus peuplé de Pretoria et de Johannesburg, a plus que doublé le nombre d’hospitalisations au cours du mois dernier. Près des trois quarts des cas récemment signalés sont dus à des mutations Omicron. Le pourcentage de tests positifs est passé de 2% à 9% en moins d’une semaine.

“Omicron n’est pas cliniquement dangereux et nous ne sommes pas encore alertés du premier signal, mais il est probable qu’il y aura plus de cas en raison de la vitesse de transmission”, a prévenu Salim Abdul Karim. Mais les scientifiques pensent que le vaccin continuera d’être efficace contre les types graves qui nécessitent une hospitalisation, a-t-il ajouté. “Pas de panique, nous y sommes déjà”, a rappelé le ministre de la Santé Joe Fara que le pays est déjà confronté à des versions bêta et delta.

Comparaison difficile

Deuxièmement, le premier facteur indique-t-il la direction particulièrement contagieuse d’Omicron ? Selon les chercheurs, il est trop tôt pour souligner que d’autres éléments régionaux pourraient jouer un rôle. L’Afrique du Sud est en effet mal vaccinée et représente moins d’un quart de sa population, ce qui rend sa population plus vulnérable à l’infection.

En particulier, les variantes delta qui sont actuellement très dominantes en Europe sont rares en Europe, laissant un doute total sur la capacité d’Omicron à les remplacer. Aux côtés de l’épidémiologiste français Arnaud Fontanet, Yazdan Yazdampana, il a déclaré : « L’émergence et la distribution des mutants Omicron en Afrique du Sud ne sont pas les mêmes qu’en Europe. “Il est très difficile de comparer la dynamique qui peut se produire entre différents pays.”

En ce qui concerne la résistance au vaccin, il faut quelques semaines pour obtenir le premier facteur de la capacité du corps humain à générer des anticorps contre cette variante. Et des mois pour se faire une idée de la véritable efficacité du vaccin contre la contamination par Omicron.

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En Afrique du Sud, le pays africain le plus officiellement touché par la pandémie, plus de 2,9 millions de cas se sont produits et près de 89 800 sont décédés. Seuls 23,8% des Sud-Africains sont complètement vaccinés, plus que partout ailleurs en Afrique, mais loin derrière le reste du monde.


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